ISO9000和精益六西格瑪的主要區別如下：

    1.目標不盡相同

    ISO9000認證是一個官方的認證認可體系，ISO9001是一個合格評定的標準。ISO9000強調文件化和規范化，強調質量系統的符合性和有效性。而精益六西格瑪則是企業自行質量改進的工具和方法，強調改進的效果。企業推行六西格瑪是一種自發的行為，是自發的追求卓越的行為，是一個循序漸進的過程。精益六西格瑪的應用是沒有終點的，而ISO是一種更接近及格的評價，還會有復審。

    2.側重點不同

    企業推行ISO9000標準的目的在于建立一個符合國際標準的質量管理體系，以證實對產品質量的保證能力，從而提高企業的可信度和顧客的滿意度。質量管理體系雖然也有質量改進的要求，但是側重點還是對質量保證的要求。而精益六西格瑪本身就是一種質量改進的工具和方法，或者說是一種質量改進的哲學。特別強調質量改進而非質量保證和質量控制。

    3.改進的著眼點不同

    ISO9000改進的對象包括產品、過程和質量管理體系。ISO9000著眼于全局，力求建立一個規范化的質量管理體系，強調建立一種持續改進的機制。如采用審核、管理評審和自我評價的方式來評價質量管理體系，尋求質量改進的機會。而精益六西格瑪則著眼于局部，用項目管理的方法來實施質量改進，更強調具體的統計技術的應用。

    4.改進的方法不同

    六西格瑪是用項目的方法來改進，一步一步的；ISO9000是整體的，改善顧客的滿意度，但如何改，沒有很嚴格的要求。雖然ISO9000也強調統計技術的應用，但并未象六西格瑪一樣指明各種方法應用與質量改進的那一個過程及如何應用這些方法。精益六西格瑪法應用了大量的統計技法，通過對指標進行量化和分析，來驗證你所做出的判斷，從而避免解決問題時的憑經驗、憑直覺，或者想當然。

    5.對質量的經濟性關注程度不同

    ISO9000不太關注質量的經濟性，如ISO9000并未要求審核財務部門就是一個例證。而精益六西格瑪非常關注質量的經濟性。以經濟效益為主要考核指標，如用COPQ等指標來衡量改進的經濟效果。

    6.對員工的認識不同

    ISO9000強調全員參與，而精益六西格瑪更強調項目團隊的作用。通常組織的六西格瑪管理是由執行領導、倡導者、黑帶大師、黑帶、綠帶和項目團隊傳遞并實施的。強調對六西格瑪組織的強有力的持續不斷的培訓。

    7.對流程的認識不同

    如今，通過ISO9000認證的大多數公司組織部門是基于職能或“區域”觀點：部門和個人的職責范圍狹小。組織內部積極實施的變革局限于某些特定的部門，沒有在全組織實現優化。相反，采用流程觀點的組織會分派精益六西格瑪人員繪制現今跨部門、跨職能界限的流程圖。這樣，有助于界定清楚問題的界面，允許精益六西格瑪人員提出跨部門的解決方案。